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油菜miRNAs靶点区域遗传变异与农艺性状相关性研究取得重要进展

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油菜miRNAs靶点区域遗传变异与农艺性状相关性研究取得重要进展

近日,受国家十三五重点研发计划主要经济作物分子设计育种项目支持,我中心与中科院分子植物卓越创新中心、上海市农业科学院合作在油菜miRNAs靶点区域遗传变异与农艺性状的相关性研究方面取得重要进展,揭示了这些遗传变异对重要农艺性状的潜在影响,为油菜农艺性状改良及分子设计育种提供了重要的理论依据。

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MicroRNAs (miRNAs)是一类长度约为20-25个核苷酸的非编码单链小RNA分子,它们在动植物中参与转录后基因表达调控。植物的miRNAs靶基因主要是编码基因,如果这些编码基因的靶点区域发生变异,就有可能导致miRNAs和靶基因之间的互作发生改变,进而导致靶基因的表达发生变化,Z终引起表型的变化。本研究通过对220份油菜核心种质进行DNA重测序及变异检测,获得714万个SNPs和289万个INDELs,其中在357个miRNAs靶点区域检测出330个SNPs和79个INDELs。分析了这些遗传变异与12个油菜农艺性状之间的关系,获得了一批影响油菜表型的功能性变异,这些变异可以作为分子标记应用于油菜的分子设计育种。

2021年9月,该研究论文以“Global Analysis of the Genetic Variations in miRNA-Targeted Sites and Their Correlations With Agronomic Traits in Rapeseed”为题发表于SCI期刊Frontiers in Genetics。中科院分子植物卓越创新中心徐朋飞博士、我中心朱彦涛博士和张彦锋博士为论文的并列第一作者,穆建新研究员、何玉科研究员、杨立勇研究员和余祥博士为论文的共同通讯作者。该成果得到了国家十三五重点研发计划主要经济作物分子设计育种项目(2016YFD01019)和国家自然科学基金项目(31471883,31571261)的资助。


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